La production animale génère 54,9% du rendement brut de l’agriculture jurassienne avec 123 millions de francs, bien avant le secteur de la production végétale qui se situe à 77 millions de francs. 59 591 bovins, 5 371 moutons, 5 390 chevaux, et 2 029 chèvres pâturent les quelque 30 000 ha de prairies et pâturages que compte le Jura. La production de porcs y est peu développée... malgré la Saint-Martin. 15 165 porcs sont élevés dans les différentes porcheries jurassiennes, sans oublier les 90 689 volailles.
Structure du cheptel en Suisse et dans le Jura et rang national:
| Suisse (nombre) 2015 | Jura (nombre) 2015 | Rang national | |
|---|---|---|---|
| Bovins | |||
| Nombre | 1 554 319 | 59 306 | 9e |
| Détenteurs | 44 789 | 821 | 13e |
| Porcs | |||
| Nombre | 1 495 737 | 13 638 | 13e |
| Détenteurs | 8 528 | 139 | 14e |
| Volaille | |||
| Nombre | 10 824 616 | 141 056 | 13e |
| Détenteurs | 12 065 | 230 | 14e |
| Chevaux | |||
| Nombre | 55 479 | 3 730 | 5e |
| Détenteurs | 8 483 | 417 | 9e |